Este laboratório está equipado com um microscópio electrónico de varrimento, dispondo de monitor de imagem directa e a cores para cálculos e processamento de imagem e análise química tipo "EDS" (por dispersão em energias), por comparação com banco de padrões e com detector de elementos leves. A tensão do feixe pode variar entre 490 V e 30 000 V e a ampliação de 5x a 300 000x, com uma resolução de 3,5 nm.
Modos de operação:
A apoiar este laboratório existe um evaporador que permite o recobrimento de amostras por grafite e ouro, de modo a poderem ser observadas no microscópio.